Указ о назначении Исакова 11 сентября подписал президент Сооронбай Жээнбеков.
До назначения на пост министра, Каныбек Исаков с 2011 года работал ректором Ошского государственного университета. Он также работал депутатом Ошского горкенеша третьего созыва от фракции СДПК c 2012 по 2016 годы.
Исаков пришел на должность главы минобраза вместо Гульмиры Кудайбердиевой, которая покинула этот пост 4 сентября.
